Va ser l'any en què culminà la seva carrera en la Formula 1 amb la escuderia McLaren Mercedes, per donar pas al seu retorn a Estats Units. A finals d'aquest any inicià el seu període d'adaptació començant en la Busch Series (la segona en importància a la NASCAR darrere de la NEXTEL Cup en la que competí en tres ocasions.
Ja en el 2007 es va anunciar que seria part dels corredors de la famosa cursa de resistència estadounidense 24 hores de Daytona, en la que sortí victoriós juntament amb els seus companys de vehicle: Scott Pruett i Salvador Durán.
Juan Pablo Montoya va finalitzar la temporada del 2007 en la posició número 20 amb 3487 puntos i complint el 94.7% de les voltes pactades en la temporada 2007.
2008El 27 de gener, Montoya junt amb Scott Pruett, Guillermo Rojas i Dario Fanchitti guanya de nou les 24 hores de Daytona, fet mític pel pilot ja que només falta que corri (i guanyi) en les 24 horas de Le Mans per ser el pilot que ha guanyat qüasi totes les carreres més importants de l'automobilisme mundial.